哺乳動物細胞系：對于常見的貼壁或懸浮哺乳動物細胞系（如 HeLa、HEK293T），常規的 Western 裂解液（含 SDS、Tris - HCl、NaCl 等）可高效裂解細胞。SDS 能迅速破壞細胞膜，使蛋白質變性，釋放細胞內總蛋白，適用于 Western Blot 檢測蛋白表達水平；溫和型 IP 裂解液（含 Triton X - 100 等）則可保留蛋白質天然構象，滿足免疫沉淀研究蛋白質相互作用的需求。例如在研究腫瘤細胞信號通路蛋白時，Western 裂解液提取的蛋白可清晰顯示蛋白表達量變化，IP 裂解液則能有效富集相互作用蛋白復合物 。

原代細胞：原代細胞結構和功能更接近體內狀態，但相對脆弱。使用裂解液時需避免過度處理，宜采用溫和裂解條件和低濃度表面活性劑的裂解液，以減少對細胞內蛋白質結構和功能的破壞。如在神經原代細胞研究中，強裂解液可能導致離子通道蛋白等敏感蛋白失活，而溫和裂解液配合輕柔的振蕩或短時超聲，既能有效裂解細胞，又能維持蛋白質活性，保證后續實驗中蛋白功能分析的準確性 。

細菌和酵母細胞：這類細胞具有細胞壁，普通裂解液難以滲透。處理細菌樣本時，常需添加溶菌酶先破壞細胞壁，再配合含有較強去垢劑（如 Sarkosyl）的裂解液裂解細胞膜；酵母細胞則可通過研磨珠破碎結合裂解液處理。相較于哺乳動物細胞，細菌和酵母細胞內蛋白質種類和豐度差異大，裂解后需注意去除核酸等雜質，避免干擾后續蛋白質分析。例如在研究酵母細胞周期蛋白時，需優化裂解液成分和處理方法，確保目標蛋白充分釋放且雜質干擾最小化 。

軟組織（如肝臟、脾臟）：軟組織細胞間連接相對疏松，但細胞類型多樣，蛋白質組成復雜。使用添加蛋白酶 K 等消化酶的裂解液，可幫助分解細胞間質，促進細胞裂解和蛋白質釋放。在肝臟組織蛋白質組學研究中，此類裂解液能有效裂解肝細胞、庫普弗細胞等多種細胞，獲得全面的蛋白質提取物，但需注意控制消化酶用量和作用時間，防止蛋白質過度降解 。

纖維成分較多的組織（如肌肉、皮膚）：由于含有大量膠原蛋白等纖維成分，單純裂解液處理難以充分裂解細胞。需結合機械勻漿（如組織勻漿器）或超聲破碎等物理方法，先破碎組織，再利用裂解液釋放蛋白質。在肌肉組織研究中，物理破碎使肌纖維結構破壞后，裂解液才能有效滲透到細胞內。同時，此類組織中纖維蛋白含量高，提取蛋白質時需通過離心等方式去除沉淀，避免影響后續分析 。

植物組織：植物細胞具有堅硬的細胞壁（主要成分是纖維素、果膠等），需使用含有纖維素酶、果膠酶等成分的裂解液，先破除細胞壁，再裂解細胞。此外，植物細胞內含有大量次生代謝產物（如酚類、多糖），這些物質會與蛋白質結合，影響蛋白質提取和后續實驗。因此，植物組織裂解液中常添加 PVP（聚乙烯吡咯烷酮）等吸附劑去除酚類物質，通過高鹽 - 低 pH 等緩沖體系分離多糖，以獲得高質量的植物蛋白質提取物 。